A cirurgia bariátrica está indicada para os pacientes adultos que apresentam IMC maior que 40 Kg/m2, ou entre 35 e 40 Kg/m2 se acompanhado de co-morbidades. O paciente deve estar completamente consciente dos riscos e benefícios e estar disposto a mudar seu estilo de vida, seu padrão alimentar e seguir as orientações e o acompanhamento médico.

Embora os critérios de indicação e contra-indicação sejam relativamente objetivos, o grande fator decisivo para se levar um paciente obeso à cirurgia é a sua motivação para optar pela cirurgia, seja por fatores de saúde, limitação física, auto-estima ou qualidade de vida.